炭疽杆菌群体基因组学测试

检测项目

1.核酸提取与质检：细菌基因组脱氧核糖核酸提取，核糖核酸提取，核酸浓度与纯度测定，完整性测试。

2.测序文库构建：全基因组鸟枪法文库构建，靶向富集文库构建，脱氧核糖核酸片段化与末端修复，接头连接与文库扩增。

3.高通量测序分析：全基因组二代测序，群体样本混池测序，长片段三代测序。

4.原始数据质控：测序数据质量测试，低质量读段与接头序列过滤，宿主序列去除。

5.基因组组装与注释：细菌基因组从头组装，参考基因组比对，编码基因与功能元件预测注释。

6.群体遗传变异分析：单核苷酸多态性检测与筛选，插入缺失变异检测，基因组结构变异分析。

7.核心基因组与系统发育分析：核心基因组序列提取与比对，系统发育树构建，遗传聚类与分型。

8.毒力与耐药基因分析：毒力因子基因数据库比对筛查，抗生素耐药基因鉴定与分型，质粒携带基因分析。

9.溯源与传播链分析：基于单核苷酸多态性的分子钟推断，传播路径与方向模拟，潜在传染源关联性分析。

10.群体进化分析：选择压力分析，基因流与重组事件检测，进化速率计算。

11.数据可视化与报告：群体遗传结构可视化，系统发育树与传播网络图绘制，综合性分析报告生成。

检测范围

临床分离的炭疽杆菌单菌落、患者病理组织样本、血液样本、环境土壤样本、水体样本、动物组织样本、疑似污染食品样本、饲料样本、皮毛样本、实验室内保存的菌株、气溶胶采样滤膜、可疑粉末样本、生物恐怖袭击相关物证样本、疫苗生产用菌种、进出口检疫截获的疑似生物样本

检测设备

1.自动核酸提取仪：用于高效、稳定地从复杂样本中纯化细菌基因组脱氧核糖核酸与核糖核酸，确保下游测序质量；具备防气溶胶污染设计。

2.微量分光光度计与荧光计：用于精确测定核酸样本的浓度与纯度，测试其是否满足建库要求；可检测微量样本。

3.高通量基因测序仪：进行大规模并行测序，一次运行可产出数百亿碱基对的数据，是群体基因组学分析的核心设备；支持双末端测序模式。

4.长读长测序仪：生成数千至数万碱基对的超长读长序列，用于解析基因组复杂区域、完成图组装及结构变异检测。

5.聚合酶链式反应仪：用于测序文库构建过程中的脱氧核糖核酸扩增与富集，以及特定靶标的验证性扩增。

6.生物分析仪：通过微流控芯片电泳技术，对脱氧核糖核酸片段大小分布、文库质量及最终测序片段进行高灵敏度定量与质控。

7.高性能计算服务器集群：提供大规模测序数据存储与并行计算能力，用于运行基因组组装、比对及群体遗传学分析等生物信息学流程。

8.生物信息学分析软件平台：集成从原始数据质控到最终结果解读的全套分析流程，包含序列比对、变异检测、进化树构建等高技术算法模块。

9.生物安全柜：为涉及活菌操作的前处理步骤提供生物安全防护，确保操作人员与环境安全，符合病原微生物实验要求。

10.超低温储存箱：用于长期稳定保存原始样本、提取的核酸、构建的文库及重要菌株，确保生物样本资源的可追溯性与可用性。

北京中科光析科学技术研究所【简称：中析研究所】

报告：可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期：7~15工作日，可加急。

资质：旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试：严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试：支持定制化试验方案。

售后：报告终身可查，工程师1v1服务。

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外).

CMA/CNAS等证书详情，因时间等不可抗拒因素会发生变更，请咨询在线工程师.